Moin Daniel,

das ist ganz einfach:
Der IE ist im Prinzip die Basis für den Explorer und, in weiten Bereichen, für die Shell.
Oft bedingt ein Austausch des IE auch einen Austausch der Shell32.dll.

Das ist übrigens besonders gut zu sehen, wenn man mal versucht den IE als Shell einzutragen. Standardmässig ist dort die Explorer.Exe angegeben. Trägt man statt dessen den IE ein, so sieht man keine Veränderung
Trägt man irgend ein anderes Programm ein, so startet dieses anstatt des Explorers (der ja auch den Desktop bildet).
Aber vorsicht mit Experimenten:
Man kann sich unter Umständen das OS so zerschiessen, dass man die Shell nicht mehr austauschen kann, bzw. nur noch über einen Remotezugriff, und das kann ja nicht jeder machen. Besonders kitzelig kann's werden, wenn man auf 9x/ME solche Experimente durchführt. Hier ist der Remotezugriff auf die Registry standardmässig nicht möglich. Es muss erst ein Zustatz installiert werden.


*** EDIT ***
BTW: Die Registry hat mit den Links, bis auf die Verwaltung der COM Objekte und Datentypen, gar nichts zu tun.