Kann es sein, dass die erste Instanz über den Installer installiert wurde? Kann jetzt nicht 100% sagen, aber ich kann mir gut vorstellen, dass ein Registry-Eintrag geschrieben wird, der Form:
HKLM\SOFTWARE\Firebird Project\Firebird Server\Instances
den dann die 2. Instanz hernimmt. Falls vorhanden, einfach mal versuchen den Registry-Eintrag umzubenennen.
Wie sieht denn der Connect-String aus? Im Prinzip wird ja die entsprechende Instanz über die Notation
server/port angesprochen, wo dann auch die richtige aliases.conf verwendet werden sollte.
lg,
Thomas