Es gibt zwei Abschatte (Annotations):
und
Ist das in jeder Datei so?
Ne, es gibt leider auch Dateien ohne diesen Wert. Leider...
Hier ein Haufen Beispieldateien: Hier noch ein paar Quelldateien:
https://www.dropbox.com/sh/v9bfyh9iz...Fs3a?dl=0&s=sl
Zitat:
Im 1. Abscnitt gibt es Kürzel zum Beispiel
Code:
LK_1_1_F_1
LK_1_1_K_9_R
Metastase_LK_1_2
Was sagen die aus? Nach welchen Indices wurden die erstellt und wie sollen die verrechnet werden? Da soll doch wahrscheinlich was aufsummiert werden? Nach welcher Formel?
LK = Lymphknoten
LK_1_1 = Lymphknoten 1.1 (Gibt auch 1.2, 1.3, ... und vielleicht auch 2.1 , 2.2, 2.3 (kommt auf die Zellschnitte an.)
LK_1_1_F_1 = Lymphknoten 1.1 und 1x Follikel
Metastase_LK_1_2 = Metastase im Lymphknoten 1.2 (das muss nur in einer Spalte mit 0/1 (nein/ja) eingesetzt werden, wenn es z.B. LK_1_1 und Metastase_LK_1_1 gleichzeitig gibt.
Hier ist eine Erläuterung, wie man überhaupt auf die Daten kommt:
https://www.dropbox.com/s/7tsu0kzft6...docx?dl=0&s=sl
Mit Summe meine ich einfach:
Wenn:
LK_1_F_1.........10002...3423
LK_1_F_2..........4234....22
LK_1_F_3...........23,2...12,1
Dann wird das in der Spalte "F" (Follikel) zu "3" summiert.
Dann wird jedoch noch drei Spalten gebraucht, in der alle LK_X_F_X, Wert1, Wert2 stehen.
Ich weiß das ist sehr kompliziert, daher die EXCEL Datei (unter Beispiele), wo immer unten drunter steht, wo die Daten herkommen. Ich verstehe aber total, warum das nicht so einfach ist.
Zitat:
Was soll mit den Daten aus dem 2. Abschnitt passieren?
2. Abschnitt? Meinst du die zweite Wertezeile?
Die soll einfach jeweils, wie ich schrieb: Werte mit dazu gepackt werden.
- Die Bearbeiteten Daten jeder .csv - Datei kommt in eine neue Zeile (Daten können aber mehrere Zeilen beanspruchen)
- Der Dateiname soll in der 1. Spalte stehen
( X kann Werte von: 1-20 annehmen)
- [LK_X_X] + Spalte mit Werten (LK_1_1, LK_1_2, ... stehen in einer Spalte )
- [LK_X_X] + passende [Metastase_LK_X_X] = Extraspalte: 1
- [LK_X_X] + keine passende [Metastase_LK_X_X] = Extraspalte: 0
(Metastase_LK_1_1 , Metastase_LK_1_2, Metastase_LK_1_3)
- Dahinter Summe aller [LK_X_X_F] + Extraspalte mit den Einzelnamen (LK_1_1_F usw. Z.B. 16, wenn es LK_1_1_K_1 .... LK_1_1_K_16 in der Quelldatei steht.)
- Summe aus [LK_X_X_K] + Extraspalte mit den Einzelnamen (LK_1_1_K)
- Summe aus [LK_X_X_K_X_R] + Extraspalte mit den Einzelnamen (LK_1_1_K_1_R)
- Summe aus [LK_X_X_NK] + Extraspalte mit den Einzelnamen + Extraspalten mit entsprechenden Werten (LK_1_1_NK)
Es gibt zwei Abschatte (Annotations):
und
Ist das in jeder Datei so?
ABER: Wenn die Daten anders vorliegen sollen, oder immer an der gleichen Stelle ein "Name;Perimeter;Area und Length stehen soll, dann sage ich das meinem Kumpel. Dann muss er sich halt hinsetzen und diese Stellen mit 00000 füllen.
Vielen Dank für die Hilfe