Jira ist zwar ganz nett, aber diese Nettigkeit damit zu arbeiten erkauft man sich mit einer wahren Administrationshölle.
Ich würde stattdessen YouTrack empfehlen. Ich habe beides gegeneinander evaluiert (siehe
http://dotnetninja.de/2013/03/settin...installations/) und die Erfahrungen mit Jira zeigen, dass es eben sehr "Enterprisey" ist. Will heissen, man braucht fast nen Vollzeitadmin um das Zeug am laufen zu halten. Und die ganzen Plugins und das Berechtigungssystem etc. zu managen ist auch nicht wirklich einfach. YouTrack wird installiert, ein paar Klicks und los gehts.