Erst alle offenen Rechnungen in eine Dictionary laden
Dann die
CSV-Datei einlesen und Rechnungsnummern extrahieren (bzw. das, was wie eine Re-Nr. aussieht). Jeden Kandidaten in der Dictionary nachschlagen (ob es die Rechnungsnummer gibt). Dann den Betrag von der Rechnung abziehen und -wenn vollständig bezahlt- die Rechnung aus der Dictionary entfernen (wäre ja denkbar, das Teilzahlungen möglich sind).
Eine Fehlerbehandlung gehört auch dazu, d.h. extrahierte Rechnungsnummernkandidaten, die keiner Rechnung zugeordnet werden können könnten ein Tippfehler sein oder eben gar keine Rechnungsnummer.
Bei Verdacht auf Tippfehler könnte man den Kandidaten noch mit Levenshtein (max. Distanz 1) auf die übriggebliebenen Rechnungen in der Dictionary loslassen.
Auf jeden Fall ist das etwas riskant, denn ihr habt ja offensichtlich kein festes Format für die Angabe der Re-Nr. im Betreff-Feld. Ergo muss man parsen und interpretieren. Und da ist immer eine Unsicherheit dabei.