Du kannst das mit dem Check-Parameter umsetzen.
Im Script sieht das z.B. so aus:
Code:
[Files]
Source: "MYPROG.EXE"; DestDir: "{app}"; Check: MyProgCheck
Nun kannst du in der Code-Section eine Funktion anlegen, die hier in diesem Fall MyProgCheck hieße. Wenn die true zurück gibt, dann wird die Zeile ausgeführt, sonst nicht.
In der Funktion müsstet Du dann die Ini auslesen und auswerten.