Portable-Programme kommen, denke ich, immer mehr in Mode.
Ich hatte eher den Eindruck, dass die Leute wieder mehr auf saubere Systeme achten, bei denen alles sauber installiert und das System dadurch besser vor Viren geschützt ist. Durch die ganzen portablen Programme gab es ja doch eine ganze Menge unnötiger Vireninfektionen...
Spielt aber auch keine Rolle. Wenn man portable Nutzung anbieten möchte, ist die einfachste Lösung, dass die Konfigurationsdatei bereits im Ordner vorhanden sein muss und dann auch verwendet wird. Dann muss man nur prüfen, ob diese Datei da ist und nimmt sonst das AppData Verzeichnis.
Und wenn man ein portable Zip ausliefert, ist die einfach mit drin.