Das würde ich anders lösen. Ich würde das ganze in Pakete aufteilen, die abzuarbeiten sind. Die Größe der Pakete hängt davon ab wie lange es dauert diese zu bearbeiten. Auf die Weise kannst du schnell unterbrechen, auch wenn immer das komplette Paket bearbeitet wird.
Die einzelnen Pakete kannst du dann in eine Queue packen, der Thread holt sich dann jeweils immer das nächste Paket heraus. Die Queue muss natürlich threadsicher sein. Von außen kannst du nun einfach Einfluss auf die Abarbeitung der Pakete nehmen, z.B. indem du ein Paket an Platz eins setzt und so weiter. Auf die Weise kannst du einzelne Pakete priorisieren oder nach hinten schieben.
Jo, so ließe sich das natürlich auch lösen. Wenngleich sich so eine Lösung wohl eher bei komplexeren Szenarien wirklich auszahlen würde. Bei zwei Paketen braucht man noch keine Queue, finde ich.