Dies ohne alte und neue Version zu vermischen oder ineinander überführbar zu machen.
Vermischen macht keinen Sinn, aber dafür gibt es bei größeren Projekten ja auch Branches. Ich finde es aber sehr wichtig, insbesondere bei solchen Projekten, dass die Historie nicht verloren geht. Wenn man sich später nach der Umstellung fragt, ob ein bestimmter Quelltextbereich eigentlich richtig umgestellt wurde, kann man immer noch vergleichen wie das vorher war.
Wenn man nur Zips hat, ist der Aufwand viel größer...
Dazu kommt, dass man dann vielleicht nur gegen das Zip der alten Version vergleicht und sieht, dass es dort anders war. Und dann ändert man das evtl. wieder zurück, obwohl man, wie man in einem Repository gesehen hätte, das gar nicht bei der Umstellung versehentlich geändert hat, sondern absichtlich hinterher...
Privat habe ich nur noch relativ kleine Projekte, aber trotzdem würde ich nie auf die Idee kommen so etwas ohne Quelltext-Repository zu machen.
Die beschriebene Vorgehensweise ist eher etwas für Bürokraten.
Oder wenn man sich das Leben leichter machen möchte...