Wobei ZIP+Entpacken und Auscheckten doch keinen Unterschied macht, weil es kommen doch die selben Dateien raus? (abgesehn vom fehlenden .git-Verzeichnis)
Nein, im Zip sind keine Submodule enthalten, weshalb die Datei dort fehlt. Und wenn man kein Git installiert hat, funktioniert auch das submodule update nicht, das soweit ich mich erinnere im install-Skript aufgerufen wird.