Ich kann es aus dem Code zwar nicht direkt ersehen, aber das MsgWaitXXX wartet vermutlich auf den/die Thread(s), die im weiteren Verlauf mit PostThreadMessage beliefert werden sollen. Das wird in der MS-Doku auch genauso beschrieben.

Aber trotz aller oft sicher auch berechtigter Kritik: Das Problem ist offenbar nicht in dem gezeigten Code zu finden. Das Kappen einer größeren Menge von Verbindungen und das daraus folgende Terminieren der Threads ist nicht die Ursache für das Hängen der VCL. Vielmehr löst es diese nur aus. Es geht also darum, die Ursache für den Hänger zu finden. Den Auslöser kennen wir nun ja schon.