Lies dir das mal durch:
http://ccrma.stanford.edu/courses/42...ts/WaveFormat/
Hier siehst du auch einen typischen Data-Sub-Chunk:
http://ccrma.stanford.edu/courses/42...wave-bytes.gif
Du müsstest dann nur die für den linken (bzw. rechten) Kanal rausfiltern, und neue Header schreiben. Dürfte aber mit diesem brillianten Dokument aus Stanford, und anderen Dokumenten (Google: canonical wave header) kein Problem sein!