So, hab jetzt die letzte Version vom Unionizer auf meine Homepage gepackt.
In der Readme steht drin wie es funktioniert. Eine kurze Hilfe wird auch angezeigt, wenn du das Programm ohne Parameter startest.
Bei Problemen mit fehlerhaften oder doppelten Includes kann eigentlich nicht viel passieren, da normalerweise die eingebetteten Dateien erst am Ende gelöscht werden und die neue Datei auch erst bei Erfolg am Ende gespeichert wird. Aber sicherheitshalber empfehle ich dir trotzdem, vorher einfach kurz ne Kopie der Dateien zu machen
