Wenn du ein Programm via "Ausführen als" startest, läuft es in einem anderen Benutzerkontext, nicht nur ein bisschen, sondern ganz
Allerdings läuft es in der gleichen Window-Station wie die Programme in deinem Kontext, es ist also auf dem Desktop und in der Taskleiste sichtbar.
Aus dem Taskmanager wirst du es (unter
WinNT ff.) (hoffentlich!) nicht herausbekommen, aber das ist ja gewollt so.
Was hast du also genau vor?