Moin Martin,
ich hab' mir jetzt mal die Doku zu
WritePrivateProfileString angesehen (wird bei TIniFile.WriteString aufgerufen).
Wenn unter
HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\IniFileMapping
ein Key steht in der Form <Dateiname.ini>, so wird, auf der NT-Schiene, nicht in die Datei, sondern in die Registry geschrieben.
Da es dort, standardmässig, einen Eintrag Clock.ini gibt (aber auch control.ini, win.ini...) wird keine Datei geschrieben, sondern in die Registry.
Das liegt also nicht an Delphi, sondern an Windows.