Auch das Startmenu hat ein
Handle bzw. es stellt eine Zeichenfläche dar. Also kannst du es auch "manipulieren" und darauf zeichnen bzw. Elemente überdecken usw... Worum du dich dann noch kümmern müsstest wäre, dass deine Anwendung auch etwas von einem Klick auf einen von dir gezeichneten Button mitbekommt.
Wenn du das allerdings vorhast, solltest du darauf achten, dass du den Style beibehältst (du hast ja den WinXP Standard Style, aber viele haben auch das "alte" Windows-Design oder Eigenkreationen usw...)
Vllt ist es sogar einfacher die WindowsShell durch eine eigene kleine Oberfläche zu ersetzen. (explorer.exe killen) Das würde ich dir z.B. empfehlen, wenn du ein System für öffentliche Computer schreibst, die nicht missbraucht werden sollen. (Dann ist es aber mit dem Startmenu noch nicht getan)