Die verschiedenen Hash Algos unterscheiden sich in Geschwindigkeit und Sicherheit. Typischerweise braucht ein sicherer Algo länger. Wie sicher und wie schnell die einzelnen Algos sind findest du hier
hash md5 sha vergleich. Die Wahl hängt von deinem Einsatzzweck ab. Ich denke um Dateien zu vergleichen sollte MD5 geeignet sein.