Die Information, dass die datei aus dem Internet kommt, liegt in sogenannten "alternate streams". Das ist sowas wie eine zweite Datei mit Zoneninformationen, die an dem INode der Original-Datei dran hängt (NTFS spezifisch).
Du kannst den Stream z.B. mit dem streams tool von SysInternals löschen:
http://technet.microsoft.com/en-us/s.../bb897440.aspx
Oder alternativ die Datei einmal auf einen FAT32 USB-Stick kopieren und dann wieder zurück. Damit ist die Markierung 'Kommt aus dem Internet' futsch und führt nicht mehr zu der Sicherheitsabfrage.