Mehrere Instanzen des Programms verhindern

[omata]

Ja, dann wird dein Programm für jede dieser markierten Dateien gestartet und es wird an jede Instanz deiner Anwendung eine Datei (Dateiname als Parameter) übergeben. Da du jetzt verhinderst, dass deine Anwendung mehrfach gestartet wird, wird eben nur die erste Instanz wirklich ausgeführt und somit auch nur die erste markierte Datei angezeigt.
Ob deine Parameterverarbeitung richtig arbeitet, kannst du innerhalb von Delphi testen, über Start->Parameter.

Markiere mal im Explorer Dateien und ziehe sie dann mit der Maus über deine Anwednung und laß dann die Maustaste los.