Zwischen Test- und Datenverzeichnis unterscheiden.

[jaenicke]

Such einfach zuerst im eigenen Verzeichnis nach einer Einstellungsdatei und dann erst in den Anwendungsdaten.

Liegt keine Datei in einem der Verzeichnisse, dann zeig einen Einstellungsassitenten an, der den Benutzer u.a. fragt wo die Einstellungen hin sollen, portabel oder ins Anwendungsdatenverzeichnis.
Du kannst ja da auch testen, ob das Programm keine Adminrechte hat gerade und wenn nein, ob es überhaupt ins eigene Verzeichnis schreiben könnte (wenn es welche hätte, könnte es eh schreiben, deshalb musst du die aktuellen Rechte prüfen). Dann brauchst du die Option gar nicht anzubieten, wenn das gar nicht geht.