Für einen "einfachen" Installer / Uninstaller würde ich Dir hier zu Inno Setup oder
NSIS raten. Damit kannst Du recht kompakte Setups erstellen, die genau Deinen Anforderungen hier gerecht werden. Die Updates könntest Du ja dann weiterhin mit einem eigenen Programm machen. (Habe ich auf diese Weise in einem meiner Projekte - AlphaCode Studio - gelöst).
Viele Grüße