also alle anoden zu den säulen, die ebene alle kathoden und dann die 25 säulen mit vorwiderstand + schaltung um die hohen ströme zu holen, damit der AVR nicht überlastet wird und die kathoden/ebenen über transistoren an den AVR. Und in der software immer die ebenen durchschalten und da die säulen ändern. das nennt sich multiplexing.
Hier ist ein Tut für einen 3³:
http://www.ledstyles.de/ftopic5912.html